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綜合規劃科(2111311分機411-415、421-423)
統籌規劃擬定毒防策略、召開高雄市政府毒品防制會報暨網絡工作連繫會議、法定八類休閒娛樂場所執行毒品危害防制措施之稽查、輔導暨教育訓練、綜合研考暨市政、議會業務、法制及人民陳情案、發展科技智慧毒防及毒品防制監測數據資料管理等事項。
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研究預防科(2111311分機511-513、521-524)
毒品防制宣導、推行拒毒、反毒新運動、社區毒品防制關懷站、前進社區專案、培訓種子師資、召募毒防類志願服務志工、研討會、講座與實務交流等事項。
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輔導處遇科(2111311分機601、610、611、620、621、701、702、704、730、740)
藥癮者多元處遇輔導、入監銜接輔導、家庭輔導、困難個案處理、螢火蟲家族培訓、24小時毒防諮詢專線服務、緩起訴個案醫療社區分流處遇、施用毒品兒少關懷輔導、推動家庭及多元社會復歸方案、辦理各項心理諮商、醫療補助、弱勢餐食服務及專業提升等事項。
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秘書室(2111311分機202-204)
文書、印信、檔案、出納、採購發包、事務管理、財務管理及不屬於其他科之事項。
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會計員(2111311分機305)
依法辦理歲計、會計及統計事項。
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人事管理員(2111311分機306)
依法辦理人事管理事項。